dplyr: rowwise operations
The tidyverse is an indispensable set of tools for wrangling and analyzing data. Its well-designed, intuitive API makes these tasks almost effortless, making it that much more surprising when I hit a wall for a presumable straightforward task:
Apply a function rowwise returning
TRUEif all values areNA
My preferred solution:
library(tidyverse)
df <- tibble(
col1 = c(1, 2, NA),
col2 = c(3, NA, NA)
)
df
#> # A tibble: 3 x 2
#> col1 col2
#> <dbl> <dbl>
#> 1 1 3
#> 2 2 NA
#> 3 NA NA
df %>%
rowwise() %>%
do(is_all_na = is.na(.) %>% all()) %>%
unnest() %>%
bind_cols(df, .)
#> # A tibble: 3 x 3
#> col1 col2 is_all_na
#> <dbl> <dbl> <lgl>
#> 1 1 3 FALSE
#> 2 2 NA FALSE
#> 3 NA NA TRUE
Created on 2018-10-21 by the reprex package (v0.2.1)
Session info
devtools::session_info()
#> Session info -------------------------------------------------------------
#> setting value
#> version R version 3.5.1 (2018-07-02)
#> system x86_64, darwin15.6.0
#> ui X11
#> language (EN)
#> collate en_US.UTF-8
#> tz America/New_York
#> date 2018-10-21
#> Packages -----------------------------------------------------------------
#> package * version date source
#> assertthat 0.2.0 2017-04-11 CRAN (R 3.5.0)
#> backports 1.1.2 2017-12-13 CRAN (R 3.5.0)
#> base * 3.5.1 2018-07-05 local
#> bindr 0.1.1 2018-03-13 CRAN (R 3.5.0)
#> bindrcpp 0.2.2 2018-03-29 CRAN (R 3.5.0)
#> broom 0.5.0 2018-07-17 CRAN (R 3.5.0)
#> cellranger 1.1.0 2016-07-27 CRAN (R 3.5.0)
#> cli 1.0.0 2017-11-05 CRAN (R 3.5.0)
#> colorspace 1.3-2 2016-12-14 CRAN (R 3.5.0)
#> compiler 3.5.1 2018-07-05 local
#> crayon 1.3.4 2017-09-16 CRAN (R 3.5.0)
#> datasets * 3.5.1 2018-07-05 local
#> devtools 1.13.6 2018-06-27 CRAN (R 3.5.0)
#> digest 0.6.18 2018-10-10 cran (@0.6.18)
#> dplyr * 0.7.6 2018-06-29 CRAN (R 3.5.1)
#> evaluate 0.11 2018-07-17 CRAN (R 3.5.0)
#> fansi 0.2.3 2018-05-06 CRAN (R 3.5.0)
#> forcats * 0.3.0 2018-02-19 CRAN (R 3.5.0)
#> ggplot2 * 3.0.0 2018-07-03 CRAN (R 3.5.0)
#> glue 1.3.0 2018-07-17 CRAN (R 3.5.0)
#> graphics * 3.5.1 2018-07-05 local
#> grDevices * 3.5.1 2018-07-05 local
#> grid 3.5.1 2018-07-05 local
#> gtable 0.2.0 2016-02-26 CRAN (R 3.5.0)
#> haven 1.1.2 2018-06-27 CRAN (R 3.5.0)
#> hms 0.4.2 2018-03-10 CRAN (R 3.5.0)
#> htmltools 0.3.6 2017-04-28 CRAN (R 3.5.0)
#> httr 1.3.1 2017-08-20 CRAN (R 3.5.0)
#> jsonlite 1.5 2017-06-01 CRAN (R 3.5.0)
#> knitr 1.20 2018-02-20 CRAN (R 3.5.0)
#> lattice 0.20-35 2017-03-25 CRAN (R 3.5.0)
#> lazyeval 0.2.1 2017-10-29 CRAN (R 3.5.0)
#> lubridate 1.7.4 2018-04-11 CRAN (R 3.5.0)
#> magrittr 1.5 2014-11-22 CRAN (R 3.5.0)
#> memoise 1.1.0 2017-04-21 CRAN (R 3.5.0)
#> methods * 3.5.1 2018-07-05 local
#> modelr 0.1.2 2018-05-11 CRAN (R 3.5.0)
#> munsell 0.5.0 2018-06-12 CRAN (R 3.5.0)
#> nlme 3.1-137 2018-04-07 CRAN (R 3.5.0)
#> pillar 1.3.0 2018-07-14 CRAN (R 3.5.0)
#> pkgconfig 2.0.1 2017-03-21 CRAN (R 3.5.0)
#> plyr 1.8.4 2016-06-08 CRAN (R 3.5.0)
#> purrr * 0.2.5 2018-05-29 CRAN (R 3.5.0)
#> R6 2.2.2 2017-06-17 CRAN (R 3.5.0)
#> Rcpp 0.12.18 2018-07-23 CRAN (R 3.5.0)
#> readr * 1.1.1 2017-05-16 CRAN (R 3.5.0)
#> readxl 1.1.0 2018-04-20 CRAN (R 3.5.0)
#> rlang 0.2.99.0000 2018-10-14 Github (r-lib/rlang@30d6671)
#> rmarkdown 1.10 2018-06-11 CRAN (R 3.5.0)
#> rprojroot 1.3-2 2018-01-03 CRAN (R 3.5.0)
#> rvest 0.3.2 2016-06-17 CRAN (R 3.5.0)
#> scales 1.0.0 2018-08-09 CRAN (R 3.5.0)
#> stats * 3.5.1 2018-07-05 local
#> stringi 1.2.4 2018-07-20 CRAN (R 3.5.0)
#> stringr * 1.3.1 2018-05-10 CRAN (R 3.5.0)
#> tibble * 1.4.2 2018-01-22 CRAN (R 3.5.0)
#> tidyr * 0.8.1 2018-05-18 CRAN (R 3.5.0)
#> tidyselect 0.2.4 2018-02-26 CRAN (R 3.5.0)
#> tidyverse * 1.2.1 2017-11-14 CRAN (R 3.5.0)
#> tools 3.5.1 2018-07-05 local
#> utf8 1.1.4 2018-05-24 CRAN (R 3.5.0)
#> utils * 3.5.1 2018-07-05 local
#> withr 2.1.2 2018-03-15 CRAN (R 3.5.0)
#> xml2 1.2.0 2018-01-24 CRAN (R 3.5.0)
#> yaml 2.2.0 2018-07-25 CRAN (R 3.5.0)